首先，目前超级电容和锂电池等化学电池相比，单位能量密度的价格相当高、重量体积也没有很大的优势。目前最好的超级电容的能量密度是锂离子电池30%左右(Wh/L)，这还只是实验室里面的水平，量产产品还比较低，故无法量产和价格方面的的原因，是阻碍超级电容在消费电子上广泛应用的硬伤。

其次是超级电容的安全问题，因为超级电容还没有在消费电子领域广泛应用，缺乏相应的行业标准，因此相比18650等常见的锂离子电池安全问题比较突出。为了提高效率，现在单个超级电容的ESR一般在mΩ级别，这就意味着一但短路后果非常严重（大电流）。而且目前量产的超级电容大多采用了酸性的液态电解液，若因短路或高温发生爆浆后果很严重，可能会造成化学灼伤，而凝胶或固态介质的锂电池就没这个问题。

此外就是电路设计的问题了。目前量产的超级电容单体最高电压只能到达2.7v左右，而且超级电容的储能特性曲线是由0v开始的，这就意味意一旦单体电压降到1v以下剩余的能量就很难再利用了。若多个电容串联，体质不一还需要额外设计储能和负载均衡电路。

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